丝状真菌丛枝菌

时间：2014-08-21

来源：深圳市安必胜科技有限公司 转载请注明出处

MOBIO的技术团队参加了芝加哥举行的*四届阿尔贡土壤宏基因组学会议，其中较热的话题就是丝状真菌。技术部的热线响个不停，来电有许多咨询如何提取丝状真菌DNA和RNA，貌似全宇宙都在关心丝状真菌。所以很值得在技术文章里头占一篇只之地。

真菌是种很有趣的微生物。有哪个物种的大小既能是一个细胞，也能长到迄今为止已知地球上较大的生物体，足足占地4平方英里（在俄勒冈州的蓝岭）？对的，它是就真菌。真菌无处不在，有些是有益的，有些很美味，有些则剧毒！无论你对它有什么样的看法，都不妨碍它们作为较顽强的微生物。

是什么造就它们的顽强？

是什么让它们那么难裂解？为什么它们能承受住早该让其它微生物化成一勺质子和中子的加热及珠磨研磨？它们细胞壁的成分真实其**的关键。真菌使用了葡聚糖和几丁质共同保护它们的细胞膜。几丁质加上钙盐也是昆虫外骨骼的重要成分，组成了甲壳动物的保护盾。或者说是生物水泥。

几丁质是乙酰葡糖胺通过β1、4糖苷相互连接聚合而成的。该结构还能增强聚合物之间的键连接，早就了几丁质的仿生强度。（见左图）

显然这层细胞壁让真菌熬过了每一个黑暗时刻。快速搜索真菌的进化史不难找到很多有趣的信息，一句话总结下来，较早具有真菌特征的化石出现在原生代，约1430million年前。

回到本篇主题：教你如何提取真菌中的DNA和RNA。根据样品类型，MOBIO提供多款试剂盒供选择。

提取纯培养的DNA和RNA

要提取纯培养的DNA，我们建议使用含有玻璃研磨珠的PowerLyzer UltraClean Microbial DNA Isolation Kit配合机械研磨。实际上，需要一款强力的珠磨研磨机。涡旋仪也可以，不过我们建议在涡旋振荡前对样品进行加热水浴以增强破壁效果。对加入到含裂解缓冲液研磨珠套管的细胞进行65-70℃水浴15min。如果你有类似于PowerLyzer这样的强力珠磨研磨机，就可以省略加热步骤，但仍需要评估研磨效果，不至于研磨过头了。

要提取纯培养的RNA，可试用UltraClean Microbial RNA Isolation Kit。这款试剂盒使用了碳化硅研磨珠，其拥有锋利不规则边缘，不但能很好裂解细胞，还能剪切基因组DNA分子。

我们有些客户用PowerBiofilm DNA或RNA试剂盒也很成功。PowerBiofilm试剂盒中的化学试剂能溶解葡聚糖，破坏富含几丁质的细胞壁，使细胞更容易裂解。且PowerBiofilm试剂盒的研磨珠套管使用了不同大小的研磨珠混搭，能打碎更多细胞，尤其是纯培养的菌丝。当然富含抑制因子的环境样品也能用PowerBiofilm试剂盒移除。

土壤中的真菌DNA、RNA提取

要提取土壤中的真菌部分微生物，我们建议用含玻璃研磨珠的PowerLyzer PowerSoil DNA Isolation Kit。玻璃研磨珠更适合强力珠磨研磨机。了解更多不同类型研磨珠与土壤DNA提取的关系，点击这里。

要提取土壤RNA，较好的试剂盒是RNA PowerSoil Total RNA Isolation Kit。这款试剂盒结合了微生物RNA提取试剂盒的碳化硅研磨珠，还用上了基裂解缓冲液，确保微生物没有生还机会。因为这款试剂盒样品起始量是2g，让你可以富集低微生物含量样品的RNA。了解更多使用这款试剂盒的技巧，点击这里。

水样滤膜

当然，如果你在用标准的47mm滤膜提取水样，PowerWater DNA和RNA试剂盒就是你的可以选择。

由此可见，样品基质类型与目标微生物类型对选用试剂盒来说同样重要。

其它样品类型:

你还会想到很多样品类型：唾液、体液、血液培养物、棉拭子、粪便等等。基础答案就是，如果你有生物样品需要提取真菌DNA或RNA，我们总有方法给到你。

还有非常多有趣且较其重要的真菌等待进一步研究，MOBIO实验室有你需要的研究工具！

词条
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