SnapGene是可视化和记录您日常分子生物学过程的较简单的方法。
可视化
当您可以准确地看到自己在做什么时,克隆就更简单了。
DNA可视化
查看DNA序列的多个视图。
查看自动生成的DNA结构的图形历史记录。祖先序列可以作为单独的文件恢复。
支持分析大型序列
浏览染色体大小序列。
利用SnapGene高效的数据处理能力扫描具有数千个注释特征的大型DNA序列。
蛋白质可视化
查看蛋白质序列的多个视图。
自定义区域、站点、绑定和序列颜色的显示。
直观的序列编辑功能
轻松编辑DNA和蛋白质序列。
进行插入、删除、替换和大小写更改。复制和粘贴序列时,将自动转换功能要素。
序列颜色编码
将选定的DNA或氨基酸序列设置为这十种颜色其中之一。
为两条DNA链或蛋白质序列着色。 颜色在“映射”和“序列”视图中均可见。
功能注释
自动标注常用功能,或手动标注新功能。
使用SnapGene广泛的数据库查找DNA序列中的共同特征。 您选择的其他功能可以添加到自定义数据库中。
模拟
SnapGene提供了美观,信息丰富的窗口,可用于模拟各种常见的克隆和PCR方法。
限制站点指示器
确认限制站点适合克隆。
以粗体**显示*特的限制性位点,或选择自动定义Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶组。
限制性克隆
可视化克隆过程的所有细节。
如果您已经有了一个克隆过程的想法,那么模拟将仅花费几秒钟。如果克隆过程存在设计缺陷,还可以捕获并纠正错误。
PCR
模拟标准PCR。
使用您自己的引物,或要求SnapGene自动设计引物。产品文件将模板和引物存储在其历史记录中。
重叠延伸PCR
重叠延伸PCR法融合片段。
较多组装八个碎片。选择要连接的片段及其定位,SnapGene设计引物。
引物定向突变
使用突变引物进行**突变。
选择一个致突变引物,然后按一下按钮查看修改过的质粒。历史色彩凸显了这一变异。
Gateway克隆
模拟Gateway BP克隆或LR克隆,或同时模拟两者。
为了方便,还提供了共同的供体向量和目标向量。选择要组装的片段,SnapGene即可设计引物。
Gibson组装
通过融合较多8个片段,或将较多8个片段插入向量,模拟Gibson程序集。Gibson Assembly是一种流行的无缝克隆方法。
选择要融合的片段及其方向,SnapGene即可设计引物。线性化后的载体可以通过酶切或反向PCR产生。
In-Fusion克隆
通过将较多八个片段插入一个载体来模拟Clontech的In-Fusion克隆。 融合克隆是创建无缝基因融合的一种非常通用的方法。
选择要融合的片段及其方向,SnapGene即可设计引物。线性化后的载体可以通过酶切或反向PCR产生。
TA和GC克隆
通过TA或GC克隆捕获PCR产物。
选择传统的TA克隆或高效的GC克隆。
为了方便起见,提供了常用的TA克隆载体和Lucigen的GC克隆载体。
Annealing Oligos
将两个寡核苷酸重组以形成双链产物。
使用简单控件为限制克隆添加悬挑。
避免错误
使用SnapGene,确保构造符合您的要求,并确认您获得了所需的序列。
基因融合阅读框
确保构造中的转换功能位于框架中。
使用序列视图可以查看两个已翻译的特征是否在框架中。
与参考序列对齐
使用功能强大的对齐工具检查实际构造是否与模拟构造匹配。
请参见对齐序列与参考序列匹配的位置以及存在差异的位置的概述。
自动记录
SnapGene自动记录创建图形历史的操作,并将祖先构造存储在较终文件中。
全面的“撤消”功能
撤消几乎所有操作。
不要觉得使用SnapGene文件很复杂--追溯这些步骤很*。
历史和嵌入原型序列
查看构造的图形历史记录。
单击某个操作以**显示父序列和产品序列的相关部分,或单击PCR引物名称以查看引物序列。
单击历史树中的原型以重新生成该原型序列文件,包括其注释和克隆历史。
历史记录颜色
使用可选的历史记录标上颜色来标识序列的较新更改。
查看有关组装结构的详细信息,包括结扎的粘性末端。
拥有您的数据
SnapGene可以帮助您选择读取和共享文件,同时保持对数据的完全控制。
安全文件管理
把您的SnapGene文件放在您想要的地方。
使用您熟悉的、安全的计算机操作系统来存储和管理SnapGene文件。
从其他格式导入
支持读取许多常见的文件格式。
不仅可以导入DNA序列,还可以导入功能注释和注解。
导出标准格式
将序列,图谱或凝胶图像转换为标准格式,以与其他软件一起使用。
将序列导出为GenBank或FASTA格式。将地图或模拟的琼脂糖凝胶导出为常见的图像格式。
与SnapGene Viewer共享数据
将SnapGene格式的文件发送给同事或客户,他们可以下载免费的SnapGene Viewer来浏览这些文件。
只需将文件连同链接发送到SnapGene Viewer。就像完整的SnapGene界面一样,接收者将能够看到图谱、序列和注释。
对于开发人员
如需将SnapGene整合到您的数据分析或实验室管理软件中,请联系我们以获取有关如何读写SnapGene文件的信息。
转换文件格式
信息的公开交换至关重要,因此SnapGene和SnapGene Viewer提供了用于读取和导出常用文件格式的选项。
从另一种格式导入时,目标不仅是捕获DNA序列,还要捕获注释和注解。如果在导入文件时遇到故障,或者想要支持新的文件格式,请与我们联系。
系统需求
SnapGene可适用于Windows和Mac系统。
北京天演融智软件有限公司(科学软件网)是 SnapGene 软件在中国的授权经销商,为中国的用户提供优质的软件销售和培训服务。
词条
词条说明
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