AlleleID 物种识别和分类鉴别的综合软件

时间：2022-09-21

科学进步

细菌鉴定的实验设计

AlleleID是一款旨在解决细菌鉴定、病原体检测或物种鉴定的综合性桌面工具。以CulsSTW多序列比对为核心，AlleleID可以设计用于物种识别/交叉物种鉴定的基因芯片探针以及用于实时PCR的SYBR Green, TaqMan MGB, TaqMan探针, Molecular Beacons以及实时PCR引物。AlleleID还提供了支持可变剪切片段检测的微阵列实验设计。

物种鉴定分析/跨物种实验/等位基因鉴定分析

AlleleID使用ClustalW对序列进行排列，并分析保存和物种特定区域。您可以使用程序进行实时PCR引物设计（包含SYBR Green引物设计）和双标签探针设计（TaqMan probes,

TaqMan MGB and molecular beacons）。这些检测方法只用于进行菌株检测或从混合菌株中找到感兴趣的物种。为了进行交叉物种试验，AlleleID通过识别保守区域来设计通用探针。对于相关的生物体，当研究物种的基因组草图不可用时，可以使用AlleleID来研究其基因表达。这些强大的功能可以帮助解决了很多具有挑战性的难题，例如的检测、鉴定、定量以及污染物、环境等的监测。

检测成功的复杂算法

高度特异性寡核苷酸通过回避自动注释BLAST搜索结果找到的显著同源性区域而设计。实时定量PCR引物和探针阻止模板形成二级结构提升效率。"Minimal Set"，该程序较具创新性的特点之一，有助于设计较少数量的等位基因特异性寡核苷酸引物和双标记探针，其*特地识别来自混合物的所需物种/菌株/类群中的每一个，降低化验成本。对于类群或跨种分析，当类群或类群高度不同时，该特征尤其有用。对于一组预先设计的、经过验证的引物集合，AlleleID可以设计兼容的引物和探针的其余序列的物种鉴定或类群特异性检测。

广泛支持实时或定量PCR检测和SNP/表达微阵列
AlleleID可以设计较优的SYBR Green引物、TaqMan探针、TaqMan Minor Groove Bingding

(MGB)探针、FRET探针或者分子信标，用于实时定量PCR差异基因表达SNP基因型分类试验。您也可以设计实时PCR引物和双标记探针多达一万个序列在一个单一的运行SNP检测或表达微阵列。

设计Luminex xMAP试验
基于Luminex’s xMAP技术，AlleleID可以设计应用于悬浮阵列系统的应变-微分多重分析设计。如果您研究的是密切相关的生物体，这个功能可以帮助您在一个反应体系中进行等位基因特异性引物延伸（ASPE）和DHA检测。

多路连接依赖探针扩增（MLPA）检测拷贝数和突变检测

AlleleID是一设计MLPA合成探针或者由MRC Holland引入的多重连接依赖探针扩增技术的程序，当合适的工具包不可用时，研究人员能够扩展这项技术。这是一种快速增长的高通量基因图谱分析方法。可以检测外显子缺失、拷贝数变化和CpG甲基化模式。具有成本效益合适、敏感性高、特异性好和可再生性好等特点。

AlleleID为PamGene检测设计了mRNA特异性,DNA特异性和突变特异性MLPA探针。这将使PamChip用户在使用PamGene高精度检测平台时设计自己感兴趣的基因探针检测。结合这两种技术，拷贝数的变化和突变可以很*地在6小时内检测到。

功能特征

物种鉴定试验

基因芯片的基因拼接/选择性剪接

外显子连接引物设计

实时PCR引物设计

TaqMan探针设计

SyBR绿色底漆设计

分子信标设计

FRET探针设计

微阵列探针设计

精密化验设计

数据库支持

输入输出格式

北京天演融智软件有限公司（科学软件网）是 AlleleID 软件在中国的授权经销商，为中国的用户提供优质的软件销售和培训服务。

18510103847

词条
词条说明
GAMS 运筹优化软件介绍
GAMS是一个用于数学规划和优化的高级建模系统。它由一个语言编译器和一系列相关的求解器组成。GAMS建模语言允许建模者快速地将现实世界的优化问题转化为计算机代码。然后GAMS语言编译器将这些代码翻译成求解器可以理解和求解的格式。该体系结构提供了较大的灵活性，允许在不更改模型公式的情况下更改所使用的求解器。GAMS具有开发、调试、部署和维护优化模型所需的所有功能。可以用GAMS来表示大量的数学模型类
EndNote 专业的参考书目软件
EndNote不仅仅是一个reference manager，更是在搜索、组织、撰写、发布和分享过程中，推动您的研究进程。协同工作并访问同一个参考库访问同一个参考库的人员可多大100人，无论他们在哪或他们是属于什么组织。几秒内即可整理数年的工作在参考元数据、全文期刊文章、文件附件和您的个人注释和注解中搜索，短短几秒钟就可以找到您需要的研究。克服研究局限对于前期来说，保存和共享尽可能多的引用、文档和
通州spss流程
通州SPSS流程在当今信息爆炸的时代，数据分析变得越来越重要。而SPSS作为一款良好的统计软件，在社会科学、医学、商业等领域有着广泛的应用。那么，作为一家软件服务提供商，科学软件网如何为用户提供通州SPSS流程的服务呢？让我们来看看科学软件网是如何用户应用SPSS进行数据分析的。步：咨询与选型在使用SPSS之前，用户往往需要咨询并选择适合自己需求的版本。科学软件网拥有丰富的SPSS产品知识和经验丰
免费资源|MAXQDA软件视频课程及直播培训
MAXQDA是一个用于质性、量化和混合方法数据分析的专业软件，适用于Windows和Mac两种操作平台，深受**成千上万用户的喜爱。始创于1989年，具有多年为研究者们提供强大、创新和便捷的数据分析工具的经验，助力研究项目的顺利开展。MAXQDA可以分析的数据类型包括访谈记录、报告、表格、在线调查、焦点小组、视频、音频、文献、图片等等。为了大家能够更好的学习和应用软件，北京天演融智软件有限公司（科