CrystalMaker 晶体和分子结构可视化软件

时间：2020-12-14作者：北京天演融智软件有限公司浏览：123

CrystalMaker是可视化晶体和分子结构的较有效的方法。它的互动设计让您不会一叶障目，并建立您自己对复杂材料的视觉理解。CrystalMaker追赶了传统的晶体学软件，允许您使用可旋转的动画创建动态可视化。能量建模工具可以让您设计和放松新的结构，预测它们的振动特性，并探索它们与其他材料的接口。







左上图：多个晶格平面-这些对称相关的平面是由程序自动生成的；右上图：广泛的新的纽带风格，比如苯甲酸上的双键和点键；左下图：电子密度计算，如简单立方晶体的轮廓图;右下角：孔隙可视化，如铜的“填充空间”描绘。

CrystalMaker提供了一个高效的工作流程，将您的数据文件拖拽到程序中，以逼真的彩色照片即时显示。使用鼠标实时操作结构。多视图“书签”和撤销功能鼓励探索和发现——这是教学和研究的理想选择。

集成结构库——可添加自定义结构库

CrystalMaker X包括一个含1200多个结构的集成结构库：带注释、索引和预览——随时可以显示。该库包含400多种矿物（所有主要的造岩矿物以及更多的矿物），以及重要的无机和**晶体和分子，从布基球到沸石、从牙科陶瓷到高温**导体。还包括一个水晶化学式结构的教学库，还有主题库，涵盖了化学战、药物化学、食品香料等。

您可以在Library Browser中按文件夹或平面视图浏览结构，也可以通过选择缩略图并使用注释查看旋转结构来简单浏览。这不仅仅是一个静态的库：您可以添加您自己的内容，将结构分组到文件夹中，并利用CrystalMaker强大的搜索功能：通过文件名、注释或化学公式进行搜索。




数据输入和输出

虽然内置的库对教学很有帮助，但研究人员想要可视化他们自己的数据——CrystalMaker可以做到。CrystalMaker X允许您从40多种不同格式导入数据，具有即时显示和强大的定制功能。CrystalMaker可以处理多结构文件，如DL_POLY HISTORY——使用CrystalMaker的synchronization和animation功能来快速理解结构行为、晶格动力学和可视化模拟轨迹。CrystalMaker也可以处理真正巨大的结构。利用我们*特的“Depth Profiling”工具，快速扫描对大型结构感兴趣的区域——非常适合描述计算机模型的结果。




可导入的数据格式




快速创建新的晶体和分子

使用CrystalMaker，您就可以创建任何一种晶体或分子结构——快速而简单。内置的对称处理和优雅的空间组浏览器将使结晶学摆脱困境，程序将自动生成所有的键和多面体。分子构建更简单：点击添加原子和键。使用新的Relax命令来较小化能量和优化您的结构。

CrystalMaker提供了广泛的模型类型，包括传统的“球和棒”、空间填充、多面体、线框和热椭圆。每个模型类型都可以进行广泛的定制，可以选择照片逼真的图形或更简单的线条艺术显示。CrystalMaker为数百万个原子、键和多面体提供连续的绘图范围设置。

出色的3 D图形

CrystalMaker X采用业界良好的3D图形，以惊人的、快速的像素实现**的视觉效果，并具有**的重叠校正和半透明性。在较新的Macs或Surface Pro设备上享受高分辨率的“Retina”图形。保存出版物质量的图形——具有透明度——或者生成旋转结构或动画的迷人视频。




实时操作

用鼠标单击并拖动，使用键盘或工具栏。查看平行于一个向量或平面正态。利用触控板的多点触控旋转和缩放功能，或者在空间中使用简单的手势，使用一个跳跃动作控制器。CrystalMaker for Mac——作为一个适合本地Mac应用程序——为新MacBook Pro提供**的触控杆界面，使用**的触摸表盘、方向预设、滑块旋转和缩放。




多结构动画

CrystalMaker是**个追赶静态结构的程序，让您快速而轻松地探索结构行为。只需将文件拖放到同一个窗口中，然后重新排列它们的缩略图来构建您的电影时间轴。操作和同步视图，拖放缩略图来重新排列它们，然后点击播放按钮并可视化动画。它并不止于此：CrystalMaker X允许您旋转和缩放动画，改变它们的模型类型，查看方向和模型设置。最后，您可以将您的动画导出为电影——用于web或演示。




创建引人入胜的教学内容

CrystalMaker文档可以保存多个结构，每个结构都有自己的图形缩略图。虽然一个明显的应用程序是用于结构行为和动画，但您也可以保存相同结构、不同模型类型、原子范围或相关结构的不同视图。由于每个结构都可以有自己的注释，因此这是一个理想的教学工具——一个完整的交互式幻灯片，带有可旋转的3D模型，在上下文中呈现。课程中包含了如何构建有吸引力的教育内容的示例（例如，“构建Quartz”、“构建Spinel”）。

体积数据可视化

CrystalMaker X允许您将任意数量的3D数据集与当前的结构结合起来，每一个都有自己的视觉设置。您可以将从文本文件中导入的数据可视化，或者在程序中生成电子密度或孔隙度计算。

强大的测量功能

CrystalMaker提供易于使用的屏幕工具，用于测量协调环境——键距、角度、扭转角度——只需点击鼠标，或滚动不同的原子和键即可实现实时输出。您还可以通过实时的半径调整来可视化协调簇和壳，例如，用一只鼠标构建一个球形纳米颗粒。详细的键距和角度信息可以在屏幕上显示，也可以导出到文本文件中。强大的距离资源管理器允许您以图形方式可视化协调环境，围绕任何元素或站点的组合。

分子模型和振动模式

CrystalMaker X提供了一个强大的、*特的能量模型引擎，它可以让您把粗糙的、手绘的分子结构转化为低能量的三维结构。实时可视化放松——您甚至可以在它放松的时候旋转您的模型。这项工作是与世界良好的英国科学家合作的一个为期三年的研究项目的成果。我们相信它能为您提供分子建模的较佳实用解决方案——只占竞争对手产品成本的一小部分。







分子晶体工具

我们的口号是让您“看得到树上的木头”，尤其是在处理复杂的分子晶体时。通常不仅仅是不对称的单元——开始的包装——而其他程序则在单位细胞边缘与碎片分子作斗争。

CrystalMaker X的**工具可以让您显示一个单元格的完整内容，分离单个分子或显示不对称单元。您可以修复“碎片化”的分子，沿原子较近的邻居“增长”绘图范围，并从复杂性上讲得通。

转换和晶体工程

CrystalMaker可以让您转换单元格，改变晶格类型，建立一个supercell，移动原点，或者应用一个任意的矩阵变换。您还可以将单元投射到选定的晶格平面上，以创建一个“表面单元”。与传统软件不同的是，CrystalMaker有一个优雅、易用的界面，有一些常见的选择作为预设。

CrystalMaker的选择工具可以让您移动、分离、复制、隐藏、删除原子组。隐藏或修复分子碎片-隔离单个分子。在任何方向上显示晶格层，将晶体切片，以调查表面或内部的平面，并将一个结构或分子放置在另一个结构中。CrystalMaker的实时晶体工程工具让您在您的水晶晶格中插入空间，在晶体中放置新的原子或整个分子，并设计新的水晶晶格。

3D打印和模型输出

CrystalMaker允许您通过STL 3D文件导出选项（大多数3D打印机广泛支持）打印您的3D模型。您还可以将任何结构导出为自包含的COLLADA 3D文件，理想地与3D图形软件交换。更妙的是，您可以在iPad上查看您的CrystalMaker COLLADA文件！把您的文件放进iBooks Author（从Mac app store免费下载），然后发布到您的iPad上。




支持衍射

衍射条纹可以模拟任何显示的晶体结构，只要一个菜单命令——CrystalDiffract（粉末衍射）和SingleCrystal

（x射线、中子和TEM单晶衍射）程序。SingleCrystal可以与CrystalMaker相连，所以当您旋转您的结构时，

它的衍射模式也会旋转，反之亦然。




跨平台

CrystalMaker有两个不同的版本，分别是Windows（Windows 7-10），或者macOS（“Yosemite”到“High Sierra”）。Mac和Windows版本共享相同的二进制文件格式和类似的特性集，使得跨平台工作和协作变得容易。每个版本都是为各自的操作系统设计的，提供了真正的操作系统支持和较大性能。

*的支持

使用CrystalMaker很容易——但是为了尽可能快地获得较新的速度，我们还提供了一个方便的教程，旨在让您熟悉基本的程序特性。在线帮助提供了对接口和功能的快速引用——并且对于较终的引用，我们包含了一个非常详细的、有插图的160页用户指南。这是用Adobe PDF格式提供的，便于搜索——并包含快速浏览的页面缩略图。

更多详情请登陆 科学软件网 。





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