体化 DNA 基因测序加速解决方案

时间：2021-03-23

应用背景 “下一代测序（NGS）”正**人类走向一个新的精密医学时代。其目的是精准定制**方案，基于基因数据库为不同的病患者提供药物，尤其是癌症， **和**疾病的医疗。越来越多的国家愿意建立对*症的基因数据库，管理他们自己的基因。然而，在基因库中有 6.4 亿 DNA，它变成了 100GB 的数据，面临的挑战是如何有效的处理这些数据。解决方案基因测序加速解决方案是以科学方式为科研人员节省时间。它应用于全基因组测序（WGS）、全外显子组测序（WES）、癌症诊断等领域。基因测序加速解决方案提供一个无痛的升级过程，使用本地 BWA-MEM 和 GATK 处理种系管道的二代测序。使用者可以在不更改工作流的情况下完成对齐、测序、标记复制和变量调用的分析。随着本机快速算法的加速，SNPs 和 INDELs 的整体精度为 99.9%，与原始软件相同。此外，加速解决方案提供与原始软件完全相同的输出文件格式。通过将研华 SKY-7210 服务器与伟萨科技的 FPGA 卡相结合，专为精密医疗行业设计出一种优化和加速数据处理的基因测序一体式服务器。系统描述基因测序加速解决方案是以科学方式为科研人员节省时间。它应用于全基因组测序（WGS）、全外显子组测序（WES）、癌症诊断等领域。基因测序加速解决方案将 Intel® Arria 10 张 FPGA 卡和研华 SKY-7210 2U 机架式服务器搭配，在服务器上部署大数据和深度学习提供了一个平台，支持高达 3TB DDR4 插槽、3x NMC（网络夹层卡）和 2x 300W GPU 或 6x 150W GPU，有助于减少从 HDD 到 FPGA 的数据移动延迟，为数据中心提供了良好性能和灵活应用。生物信息采样导入到DNA序列母系（NIPT）癌症和疾病 WASAI FPGA SKY-7210 2U机架式混合网络服务器 FASTQ 医疗数据中心为什么选择研华 • SNPs 和 INDELs 的整体精度为 99.9%，与原始软件相同 • 基因测序加速解决方案使用本地 BWA+GATK 算法，可应用于多个程序 • 提供集成 FPGA 和服务器的一体化解决方案 • 种系分析变异管道处理时间从近 33 小时缩短到不足 8 小时 SKY-7210 2U 机架式混合网络服务器
济南研浩电子设备有限公司专注于研华工控机,研华原装机,研华机箱等

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