SnapGene 日常分子生物学软件

时间：2022-09-08作者：北京天演融智软件有限公司浏览：570

SnapGene是可视化和记录您日常分子生物学过程的较简单的方法。

 

可视化

当您可以准确地看到自己在做什么时，克隆就更简单了。

 

DNA可视化

查看DNA序列的多个视图。

                                             

查看自动生成的DNA结构的图形历史记录。祖先序列可以作为单独的文件恢复。

 

支持分析大型序列

浏览染色体大小序列。




利用SnapGene高效的数据处理能力扫描具有数千个注释特征的大型DNA序列。

 

蛋白质可视化

查看蛋白质序列的多个视图。




自定义区域、站点、绑定和序列颜色的显示。

 

 

直观的序列编辑功能

轻松编辑DNA和蛋白质序列。




进行插入、删除、替换和大小写更改。复制和粘贴序列时，将自动转换功能要素。

 

序列颜色编码

将选定的DNA或氨基酸序列设置为这十种颜色其中之一。

 




为两条DNA链或蛋白质序列着色。 颜色在“映射”和“序列”视图中均可见。

功能注释

自动标注常用功能，或手动标注新功能。




使用SnapGene广泛的数据库查找DNA序列中的共同特征。 您选择的其他功能可以添加到自定义数据库中。

 

模拟

SnapGene提供了美观，信息丰富的窗口，可用于模拟各种常见的克隆和PCR方法。

 

限制站点指示器

确认限制站点适合克隆。




以粗体**显示*特的限制性位点，或选择自动定义Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶组。

 

限制性克隆

可视化克隆过程的所有细节。

 




如果您已经有了一个克隆过程的想法，那么模拟将仅花费几秒钟。如果克隆过程存在设计缺陷，还可以捕获并纠正错误。

 

PCR

模拟标准PCR。




使用您自己的引物，或要求SnapGene自动设计引物。产品文件将模板和引物存储在其历史记录中。

 

重叠延伸PCR

重叠延伸PCR法融合片段。




较多组装八个碎片。选择要连接的片段及其定位，SnapGene设计引物。




引物定向突变

使用突变引物进行**突变。




选择一个致突变引物，然后按一下按钮查看修改过的质粒。历史色彩凸显了这一变异。

 

Gateway克隆

模拟Gateway BP克隆或LR克隆，或同时模拟两者。 

 




为了方便，还提供了共同的供体向量和目标向量。选择要组装的片段，SnapGene即可设计引物。

 

Gibson组装

通过融合较多8个片段，或将较多8个片段插入向量，模拟Gibson程序集。Gibson Assembly是一种流行的无缝克隆方法。




选择要融合的片段及其方向，SnapGene即可设计引物。线性化后的载体可以通过酶切或反向PCR产生。

 

In-Fusion克隆

通过将较多八个片段插入一个载体来模拟Clontech的In-Fusion克隆。 融合克隆是创建无缝基因融合的一种非常通用的方法。




选择要融合的片段及其方向，SnapGene即可设计引物。线性化后的载体可以通过酶切或反向PCR产生。

 

TA和GC克隆

通过TA或GC克隆捕获PCR产物。




选择传统的TA克隆或高效的GC克隆。

 

为了方便起见，提供了常用的TA克隆载体和Lucigen的GC克隆载体。

 

Annealing Oligos

将两个寡核苷酸重组以形成双链产物。




使用简单控件为限制克隆添加悬挑。

 

避免错误

使用SnapGene，确保构造符合您的要求，并确认您获得了所需的序列。

 

基因融合阅读框

确保构造中的转换功能位于框架中。




使用序列视图可以查看两个已翻译的特征是否在框架中。

 

与参考序列对齐

使用功能强大的对齐工具检查实际构造是否与模拟构造匹配。




请参见对齐序列与参考序列匹配的位置以及存在差异的位置的概述。

 

 

自动记录

SnapGene自动记录创建图形历史的操作，并将祖先构造存储在较终文件中。

 

全面的“撤消”功能

撤消几乎所有操作。

 




不要觉得使用SnapGene文件很复杂--追溯这些步骤很*。

 

历史和嵌入原型序列

查看构造的图形历史记录。




 

单击某个操作以**显示父序列和产品序列的相关部分，或单击PCR引物名称以查看引物序列。

 

单击历史树中的原型以重新生成该原型序列文件，包括其注释和克隆历史。

 

历史记录颜色

使用可选的历史记录标上颜色来标识序列的较新更改。




查看有关组装结构的详细信息，包括结扎的粘性末端。

 

拥有您的数据

SnapGene可以帮助您选择读取和共享文件，同时保持对数据的完全控制。

 

安全文件管理

把您的SnapGene文件放在您想要的地方。

 




使用您熟悉的、安全的计算机操作系统来存储和管理SnapGene文件。

 

从其他格式导入

支持读取许多常见的文件格式。

 

不仅可以导入DNA序列，还可以导入功能注释和注解。

 

导出标准格式

将序列，图谱或凝胶图像转换为标准格式，以与其他软件一起使用。




 

将序列导出为GenBank或FASTA格式。将地图或模拟的琼脂糖凝胶导出为常见的图像格式。

 

与SnapGene Viewer共享数据

将SnapGene格式的文件发送给同事或客户，他们可以下载免费的SnapGene Viewer来浏览这些文件。




只需将文件连同链接发送到SnapGene Viewer。就像完整的SnapGene界面一样，接收者将能够看到图谱、序列和注释。

 

对于开发人员

如需将SnapGene整合到您的数据分析或实验室管理软件中，请联系我们以获取有关如何读写SnapGene文件的信息。

 

转换文件格式

信息的公开交换至关重要，因此SnapGene和SnapGene Viewer提供了用于读取和导出常用文件格式的选项。

 

从另一种格式导入时，目标不仅是捕获DNA序列，还要捕获注释和注解。如果在导入文件时遇到故障，或者想要支持新的文件格式，请与我们联系。

 

系统需求

SnapGene可适用于Windows和Mac系统。




北京天演融智软件有限公司（科学软件网）是 SnapGene 软件在中国的授权经销商，为中国的用户提供优质的软件销售和培训服务。








北京天演融智软件有限公司专注于pscad,gams,spsspro,stata,matlab,mathematica,nvivo等, 欢迎致电 18510103847

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