游离DNA提取方法

    游离DNA提取方法

    【操作方法-离心法】

    使用前先在Buffer W1和Buffer W2中加入无水乙醇,加入体积请参照瓶上的标签。
    1. 加1.44 mL Buffer L1至5 mL离心管中,并加入40 µL蛋白酶K。
    2. 加入1.8 mL血浆或尿液样本,盖上管盖,旋涡振荡30秒,60℃孵育30min。
    *如果尿液 体积不足1.8 mL mL,则必须补加生理盐水使尿液体积达到1 mL。
    3. 加入1 mL 异丙醇,颠倒混匀离心管3-5次,-20℃保存5-10min。
    4. 将步骤3中的上清液倒入到核酸纯化柱中(核酸纯化柱置于2mL 离心管中),盖上管盖,12000 rpm 离心30秒,若体积过多,一次过滤不完,可重复该步骤,直至步骤3中溶液完全过完纯化柱(不用更换过滤柱)。
    5. 弃除滤液,将核酸纯化柱置回到2mL 离心管中,在核酸纯化柱中加入500 µL Buffer W1, 盖上管盖,12000 rpm 离心30秒。
    * 确认在Buffer W1 中已经加入无水乙醇。
    * 滤液无须彻底弃尽,如果要避免粘附在离心管管口的滤液对离心机的污染,可将2mL 离心管在纸巾上倒扣拍击一次。
    6. 弃2mL 离心管中的滤液,将核酸纯化柱置回到2mL 离心管中,在核酸纯化柱中加入500 µL Buffer W2, 盖上管盖,12000 rpm 离心30秒。
    * 确认在Buffer W2中已经加入无水乙醇。
    7. 弃2mL 离心管中的滤液,将核酸纯化柱置回到2mL 离心管中,在核酸纯化柱中加入500 µL无水乙醇, 盖上管盖,12000 rpm 离心1分钟。
    8. 弃2mL 离心管中的滤液,将核酸纯化柱置回到2mL 离心管中,14000 rpm 离心3分钟。
    * 如果离心机的离心速度达不到14000 rpm,则用较高速离心4分钟。
    * 请勿省略该步骤,否则可能因所纯化的核酸中混有乙醇而影响后续的PCR效果。
    7. 弃2mL 离心管,将核酸纯化柱置于一个洁净的1.5 mL 离心管中,在纯化柱中加入50-100 µL 60℃温育的Buffer TE或水,盖上管盖,室温静置3分钟,12000 rpm 离心1秒。
    * 如果离心机没有防泄漏的盖子,请将离心条件改为8000 rpm离心1分钟,以免管盖脱落而损伤离心机。
    8. 弃纯化柱,洗脱的DNA可立即用于各种分子生物学实验,或者将DNA储存于-20℃备用。


    【操作方法-真空抽滤法】
    使用前先在Buffer W1和Buffer W2中加入无水乙醇,加入体积请参照瓶上的标签。
    1. 加1.44 mL Buffer L1至5 mL离心管中,并加入40 µL蛋白酶K。
    2. 加入1.8 mL血浆或尿液样本,盖上管盖,旋涡振荡30秒,60℃孵育30min。
    *如果样本体积不足1.8 mL mL,则必须补加生理盐水使样本体积达到1.8 mL。
    3. 加入1 mL 异丙醇,颠倒混匀离心管3-5次,-20℃保存5-10min。
    4. 将过滤柱插入到真空泵系统的上,在过滤柱上放置20 ml的扩容管。
    *保证补充管完全插入到过滤柱上,避免样品漏出。
    5、小心地将第3步得到的裂解液的混合液加入到在过滤柱上的扩容管中,打开真空泵。当所有的裂解液完全通过柱子后,小心取下补充管,丢弃。
    *为了避免交叉污染,在相邻的过滤柱间移动时务必小心操作。
    6. 将500 µL Buffer W1加入到过滤柱中,保持柱子是打开状态,在所有的Buffer W1完全通过了过滤柱后。
    7. 将500 µL Buffer W2加入到过滤柱中,保持柱子是打开状态。在所有的Buffer W2完全通过了过滤柱后。
    8. 将500 µL的乙醇(96–**) 加入到过滤柱中,保持柱子是打开状态。在所有的乙醇完全通过了过滤柱后,关掉真空泵。
    9. 关闭上过滤柱,从真空泵上取下。将过滤柱放置在一个干净的 1.5 ml收集管中,全速(20,000 x g; 14,000 rpm)离心3 min。
    10. 将过滤柱置于一个1.5 ml收集管中,打开盖子,室温干燥2-3分钟。
    11. 小心地将50–100 µL的Buffer TE或水加入到过滤柱膜*,盖上盖子,室温孵育3 min。
    注意:保证Buffer TE或水已经平衡至室温(15–25°C)。如果洗脱液体积比较小(<50 μl),那么应该将洗脱液加入到膜*,保证能完全洗脱结合的DNA。洗脱体积是可以根据下游的不同应用进行调整的。
    12. 全速(20,000 x g; 14,000 rpm)离心1 min,洗脱核酸。

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    词条说明

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