基于 SPRI(Solid Phase Reversible Immobilization ) 技术,在磁珠法反应体系中,核酸分子(DNA & RNA)会由线性压缩成球状, DNA 在一定浓度的 PEG 存在条件下,NaCl 或 MgCl2 促进条件下,DNA 分子构象会发生急剧变化,会暴露出磷酸骨架上大量的带负电荷的磷酸基团,与表面带负电荷的羧基-COOH 磁珠结合。目前认为这种负负电荷间的作用是由于带正电荷的盐离子的作用(如 Na+)。带负电磷酸基团借由解离的盐离子(如 Na+)与羧基形成「阴离子-阳离子-阴离子」的盐桥结构,使 DNA 被特异性吸附到羧基磁珠表面。而当反应缓冲液被弃除后,加入水性分子,会快速充分水化核酸分子,解除三者之间的离子相互作用,使吸附到磁珠上的核酸分子被纯化出来。利用磁珠的磁性,可通过外加磁场进行收集。
受益于高通量测序技术的发展,磁珠也凭借其高通量,适用于自动化的特点备受推崇,广泛用于 NGS 文库构建中的 DNA 提取纯化及双轮分选(片筛)。
DNA 提取纯化的目的在于去除不想要的片段、回收需要的片段。由于磁珠**吸附大片段,因而可通过一定比例的磁珠吸附特定大小以上的片段,丢弃上清(去除非目标片段)后将磁珠吸附的 DNA 洗脱回收。
DNA 双轮分选(片筛)目的在于从片段中选择特定区域的 DNA 片段大小。由于磁珠**吸附大片段,因而需通过两轮磁珠操作进行分选。
兔牙生物科技研发的 BunnyMagTM 磁珠分选纯化试剂盒中的磁珠,与市面上大部分的磁珠类似,
磁珠结构(分为 3 层):
• 较内层的核心是 Polystyrene,PS
• *二层包裹磁性物质——四氧化三铁(Fe3O4)
• 较外层表面是羧基(-COOH)修饰的高分子材料
磁珠体系主要包括磁珠、聚乙二醇(PEG)、盐离子(NaCl)
兔牙科技 BunnyMagTM 磁珠的优势:
(1)样本需求量低:微量的材料即可提到高浓度的核酸;
(2)操作简单快速:整个操作流程基本分为五步(裂解、结合、洗涤、干燥、洗脱),全程*离心操作,大多可在 30~60 分钟内完成;
(3)质量稳定可靠:游离的磁珠与核酸的结合量更大,特异性的结合使得核酸纯度更高,且可通过控制磁珠表面基团来调节核酸回收量;
(4)全自动化操作:采用核酸提取仪可实现自动化、高通量操作,可实现几十甚至几百个样品的提取;
(5)安全无毒无害:试剂不含酚等有毒化学试剂,完全符合现代化环保理念。
词条
词条说明
血浆游离 DNA(cell-free DNA, cfDNA) 是机体释放到血浆中游离于细胞外的碎片化 DNA 片段,研究发现外周血 cfDNA 水平的增加与许多临床疾病(如组织损伤、炎症、癌症及妊娠等)的发生发展密切有关。cfDNA 检测与分析,是当下医学诊断方法中的一个重要领域,特别是**诊断和无创产前筛查等领域。cfDNA 的质量会直接影响下游应用检测结果的准确性和稳定性。兔牙生物科技全新推出
高通量测序技术在**基因检测中应用广泛。一方面通过基因测序可以找出癌症的突变基因,从而迅速确定对症药物;另一方面,样本类型可以是患者的血液甚至唾液,*传统的病理切片,减少诊断过程中对患者机体的损伤。下面我们来简单介绍NGS在**样本基因检测应用中的流程。1、样本接收与质量控制血浆样本要求:用于ctDNA检测的血液采集量必须在8ml以上,使用专业的BunnyTubeTM游离DNA样本保存管室温保存
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